Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms