Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC32Q9BV29 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms