Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2E2Q96LR5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms