Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDLIM2Q96JY6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms