Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP2Q96HF1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms