Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 GRINA-207ENST00000531992 597 ntTSL 218.02■□□□□ 0.482e-11■■■■■ 27.6
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SF3A3Q12874 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.417e-15■■■■■ 27.5
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SF3A3Q12874 IL32-225ENST00000548246 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.983e-7■■■■■ 27.5
SF3A3Q12874 SMARCA1-201ENST00000371121 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.358e-7■■■■■ 27.4
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SF3A3Q12874 SMARCA1-202ENST00000371122 4099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.758e-7■■■■■ 27.4
SF3A3Q12874 SMARCA1-203ENST00000371123 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.828e-7■■■■■ 27.4
SF3A3Q12874 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.681e-6■■■■■ 27.4
SF3A3Q12874 DNPEP-204ENST00000373966 1875 ntTSL 520.96■□□□□ 0.951e-6■■■■■ 27.4
SF3A3Q12874 DNPEP-203ENST00000373963 1657 ntTSL 517.39■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 27.4
SF3A3Q12874 SUN1-207ENST00000419312 473 ntTSL 414.28□□□□□ -0.124e-8■■■■■ 27.4
SF3A3Q12874 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 27.4
SF3A3Q12874 DNPEP-220ENST00000523282 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 27.4
SF3A3Q12874 FBRSL1-202ENST00000536075 208 ntTSL 513.48□□□□□ -0.253e-21■■■■■ 27.4
SF3A3Q12874 GRK2-207ENST00000529738 500 ntTSL 219.33■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 27.4
SF3A3Q12874 GRK2-213ENST00000533077 3453 ntTSL 212.13□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 27.4
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SF3A3Q12874 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.042e-8■■■■■ 27.4
SF3A3Q12874 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.92e-8■■■■■ 27.4
SF3A3Q12874 SERBP1-208ENST00000493607 615 ntTSL 220.36■□□□□ 0.852e-8■■■■■ 27.4
SF3A3Q12874 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.812e-8■■■■■ 27.4
SF3A3Q12874 GCLC-203ENST00000504525 1011 ntTSL 319.66■□□□□ 0.742e-8■■■■■ 27.4
SF3A3Q12874 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.542e-8■■■■■ 27.4
SF3A3Q12874 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.252e-8■■■■■ 27.4
SF3A3Q12874 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.232e-8■■■■■ 27.4
SF3A3Q12874 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 27.4
SF3A3Q12874 MTA3-211ENST00000467925 1672 ntTSL 515.22■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 27.4
SF3A3Q12874 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 27.4
SF3A3Q12874 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 27.4
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