RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454356.5

MTA3-209, Transcript of metastasis associated 1 family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene MTA3, Length 1,702 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3-209ENST00000454356 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.34■■■■■ 8.37
MTA3-209ENST00000454356 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.49■■■■■ 6.95
MTA3-209ENST00000454356 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.65■■■■■ 6.66
MTA3-209ENST00000454356 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.67■■■■■ 6.5
MTA3-209ENST00000454356 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.42■■■■■ 6.46
MTA3-209ENST00000454356 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.14■■■■■ 6.42
MTA3-209ENST00000454356 ABCC9O60706 1549 aa55.13■■■■■ 6.42
MTA3-209ENST00000454356 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.89■■■■■ 6.38
MTA3-209ENST00000454356 NACADO15069 1562 aa54.43■■■■■ 6.3
MTA3-209ENST00000454356 SCRIBQ14160 1630 aa53.89■■■■■ 6.22
MTA3-209ENST00000454356 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.87■■■■■ 6.22
MTA3-209ENST00000454356 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP53.15■■■■■ 6.1
MTA3-209ENST00000454356 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.77■■■■■ 6.04
MTA3-209ENST00000454356 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.4■■■■■ 5.98
MTA3-209ENST00000454356 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.37■■■■■ 5.97
MTA3-209ENST00000454356 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.36■■■■■ 5.97
MTA3-209ENST00000454356 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.07■■■■■ 5.93
MTA3-209ENST00000454356 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.07■■■■■ 5.93
MTA3-209ENST00000454356 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.92■■■■■ 5.9
MTA3-209ENST00000454356 SMARCA4P51532 1647 aa51.68■■■■■ 5.86
MTA3-209ENST00000454356 WIZO95785 1651 aa51.6■■■■■ 5.85
MTA3-209ENST00000454356 CHIC1Q5VXU3 224 aa51.1■■■■■ 5.77
MTA3-209ENST00000454356 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.09■■■■■ 5.77
MTA3-209ENST00000454356 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.06■■■■■ 5.76
MTA3-209ENST00000454356 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.79■■■■■ 5.72
MTA3-209ENST00000454356 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.71■■■■■ 5.71
MTA3-209ENST00000454356 SMARCA2P51531 1590 aa50.7■■■■■ 5.71
MTA3-209ENST00000454356 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.61■■■■■ 5.69
MTA3-209ENST00000454356 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.47■■■■■ 5.67
MTA3-209ENST00000454356 NCAPD3P42695 1498 aa50.3■■■■■ 5.64
MTA3-209ENST00000454356 HMGXB3Q12766 1538 aa50.23■■■■■ 5.63
MTA3-209ENST00000454356 TRIM41Q8WV44 630 aa49.93■■■■■ 5.58
MTA3-209ENST00000454356 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.86■■■■■ 5.57
MTA3-209ENST00000454356 ABCC8Q09428 1581 aa49.62■■■■■ 5.53
MTA3-209ENST00000454356 CFTRP13569 1480 aa49.27■■■■■ 5.48
MTA3-209ENST00000454356 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.25■■■■■ 5.47
MTA3-209ENST00000454356 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa49.16■■■■■ 5.46
MTA3-209ENST00000454356 SYNJ1O43426 1573 aa49.07■■■■■ 5.45
MTA3-209ENST00000454356 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP49.06■■■■■ 5.44
MTA3-209ENST00000454356 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.02■■■■■ 5.44
MTA3-209ENST00000454356 PRDM2Q13029 1718 aa48.86■■■■■ 5.41
MTA3-209ENST00000454356 TOP2BQ02880 1626 aa48.81■■■■■ 5.4
MTA3-209ENST00000454356 SOGA1O94964 1423 aa48.79■■■■■ 5.4
MTA3-209ENST00000454356 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.74■■■■■ 5.39
MTA3-209ENST00000454356 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.68■■■■■ 5.38
MTA3-209ENST00000454356 CUX1P39880 1505 aa48.66■■■■■ 5.38
MTA3-209ENST00000454356 EEA1Q15075 1411 aa48.66■■■■■ 5.38
MTA3-209ENST00000454356 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.6■■■■■ 5.37
MTA3-209ENST00000454356 NESP48681 1621 aa48.53■■■■■ 5.36
MTA3-209ENST00000454356 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.47■■■■■ 5.35
MTA3-209ENST00000454356 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.47■■■■■ 5.35
MTA3-209ENST00000454356 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.39■■■■■ 5.34
MTA3-209ENST00000454356 EHMT2Q96KQ7 1210 aa48.35■■■■■ 5.33
MTA3-209ENST00000454356 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.11■■■■■ 5.29
MTA3-209ENST00000454356 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.09■■■■■ 5.29
MTA3-209ENST00000454356 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.08■■■■■ 5.29
MTA3-209ENST00000454356 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.06■■■■■ 5.28
MTA3-209ENST00000454356 KIF21BO75037 1637 aa48.03■■■■■ 5.28
MTA3-209ENST00000454356 GOLGA3Q08378 1498 aa48.03■■■■■ 5.28
MTA3-209ENST00000454356 TOPBP1Q92547 1522 aa48■■■■■ 5.27
MTA3-209ENST00000454356 TNIKQ9UKE5 1360 aa47.96■■■■■ 5.27
MTA3-209ENST00000454356 KIF27Q86VH2 1401 aa47.95■■■■■ 5.27
MTA3-209ENST00000454356 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.9■■■■■ 5.26
MTA3-209ENST00000454356 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.85■■■■■ 5.25
MTA3-209ENST00000454356 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.8■■■■■ 5.24
MTA3-209ENST00000454356 CUX2O14529 1486 aa47.79■■■■■ 5.24
MTA3-209ENST00000454356 PRXQ9BXM0 1461 aa47.78■■■■■ 5.24
MTA3-209ENST00000454356 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.77■■■■■ 5.24
MTA3-209ENST00000454356 UBTFP17480 764 aaKnown RBP47.74■■■■■ 5.23
MTA3-209ENST00000454356 CEP162Q5TB80 1403 aa47.73■■■■■ 5.23
MTA3-209ENST00000454356 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.66■■■■■ 5.22
MTA3-209ENST00000454356 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.66■■■■■ 5.22
MTA3-209ENST00000454356 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.64■■■■■ 5.22
MTA3-209ENST00000454356 IGF1RP08069 1367 aa47.57■■■■■ 5.2
MTA3-209ENST00000454356 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.5■■■■■ 5.19
MTA3-209ENST00000454356 WDR97A6NE52 1622 aa47.43■■■■■ 5.18
MTA3-209ENST00000454356 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.29■■■■■ 5.16
MTA3-209ENST00000454356 CLIP1P30622 1438 aa47.28■■■■■ 5.16
MTA3-209ENST00000454356 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.26■■■■■ 5.16
MTA3-209ENST00000454356 WDR62O43379 1518 aa47.26■■■■■ 5.16
MTA3-209ENST00000454356 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.22■■■■■ 5.15
MTA3-209ENST00000454356 ERCC6Q03468 1493 aa47.16■■■■■ 5.14
MTA3-209ENST00000454356 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
MTA3-209ENST00000454356 PCGF6Q9BYE7 350 aa47.14■■■■■ 5.14
MTA3-209ENST00000454356 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.09■■■■■ 5.13
MTA3-209ENST00000454356 CUL7Q14999 1698 aa47.06■■■■■ 5.12
MTA3-209ENST00000454356 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP47.06■■■■■ 5.12
MTA3-209ENST00000454356 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.04■■■■■ 5.12
MTA3-209ENST00000454356 IFT140Q96RY7 1462 aa46.95■■■■■ 5.11
MTA3-209ENST00000454356 VPS8Q8N3P4 1428 aa46.91■■■■■ 5.1
MTA3-209ENST00000454356 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP46.9■■■■■ 5.1
MTA3-209ENST00000454356 ARAP1Q96P48 1450 aa46.84■■■■■ 5.09
MTA3-209ENST00000454356 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.81■■■■■ 5.08
MTA3-209ENST00000454356 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP46.8■■■■■ 5.08
MTA3-209ENST00000454356 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.76■■■■■ 5.08
MTA3-209ENST00000454356 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.75■■■■■ 5.07
MTA3-209ENST00000454356 PBRM1Q86U86 1689 aa46.73■■■■■ 5.07
MTA3-209ENST00000454356 GRIN2BQ13224 1484 aa46.68■■■■■ 5.06
MTA3-209ENST00000454356 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.6■■■■■ 5.05
MTA3-209ENST00000454356 ADAMTS12P58397 1594 aa46.59■■■■■ 5.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.3 ms