Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGCP20142 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGCP20142 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGCP20142 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGCP20142 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGCP20142 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGCP20142 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGCP20142 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGCP20142 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGCP20142 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGCP20142 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGCP20142 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGCP20142 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGCP20142 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGCP20142 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGCP20142 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGCP20142 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGCP20142 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGCP20142 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGCP20142 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGCP20142 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGCP20142 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGCP20142 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGCP20142 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PGCP20142 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGCP20142 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGCP20142 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGCP20142 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGCP20142 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGCP20142 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGCP20142 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGCP20142 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGCP20142 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGCP20142 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGCP20142 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGCP20142 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGCP20142 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGCP20142 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PGCP20142 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGCP20142 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGCP20142 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGCP20142 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGCP20142 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGCP20142 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGCP20142 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGCP20142 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGCP20142 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PGCP20142 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGCP20142 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGCP20142 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGCP20142 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGCP20142 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGCP20142 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGCP20142 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGCP20142 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGCP20142 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGCP20142 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGCP20142 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGCP20142 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGCP20142 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGCP20142 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGCP20142 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGCP20142 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGCP20142 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGCP20142 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGCP20142 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGCP20142 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGCP20142 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGCP20142 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGCP20142 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PGCP20142 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGCP20142 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGCP20142 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGCP20142 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PGCP20142 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGCP20142 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGCP20142 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms