Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DNAI1Q9UI46 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAI1Q9UI46 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAI1Q9UI46 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAI1Q9UI46 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAI1Q9UI46 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAI1Q9UI46 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAI1Q9UI46 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAI1Q9UI46 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAI1Q9UI46 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAI1Q9UI46 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAI1Q9UI46 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAI1Q9UI46 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAI1Q9UI46 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAI1Q9UI46 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAI1Q9UI46 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAI1Q9UI46 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAI1Q9UI46 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAI1Q9UI46 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAI1Q9UI46 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAI1Q9UI46 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms