Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMES1Q9C002 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms