Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms