Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM27P14373 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM27P14373 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms