Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AC034105.2-201ENST00000561866 238 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AC099684.3-201ENST00000574483 560 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 ZNHIT3-204ENST00000617429 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AC073107.2-201ENST00000620476 238 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AC022784.8-201ENST00000623764 559 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 LINC02034-201ENST00000635368 760 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 C5orf66-205ENST00000555438 3246 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 TCTN1-201ENST00000377654 1539 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 SPATA31D1-201ENST00000344803 4833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 NEK6-204ENST00000373603 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 INTS6-215ENST00000490542 2307 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 SLC2A3P2-201ENST00000331747 1480 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 FBXW11P1-201ENST00000393804 1474 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 SERPINB9-201ENST00000380698 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 RAB36-201ENST00000263116 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 GSPT1-206ENST00000563468 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 DNTT-202ENST00000630152 1954 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AP002748.4-201ENST00000419755 3547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 NLGN4Y-203ENST00000382868 5338 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 ZNF207-202ENST00000342555 1905 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 FHL5-203ENST00000541107 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 SEMA3E-202ENST00000427262 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 CRNKL1-202ENST00000377340 4406 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 TGIF1-223ENST00000618001 3030 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 TRIM66-201ENST00000299550 9753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 CCR9-203ENST00000395963 2512 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 ZNF649-207ENST00000600738 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 LRRC2-202ENST00000395905 5100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 PRDM9-201ENST00000296682 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 PDPN-212ENST00000621990 2738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 MUC22-201ENST00000561890 6019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 DUSP3-201ENST00000226004 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 CLCN5-204ENST00000376108 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 ARL4A-201ENST00000356797 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 CCNT2-AS1-203ENST00000428857 677 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 TTC28-AS1-216ENST00000437713 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 LYSMD1-202ENST00000440902 1003 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 GAPDHP50-201ENST00000464421 993 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AC025062.1-201ENST00000465163 644 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 FTH1P4-201ENST00000480365 553 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 RN7SL135P-201ENST00000490144 278 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 RN7SKP190-201ENST00000516079 286 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AC008632.1-201ENST00000519400 753 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AF279873.3-201ENST00000523063 766 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AC069235.1-202ENST00000545535 540 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 PFDN5-211ENST00000550846 392 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 PFDN5-214ENST00000551018 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 PCAT29-202ENST00000558941 545 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 C16orf45-203ENST00000561692 534 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AC087645.1-201ENST00000588528 291 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AC116050.1-201ENST00000609777 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 HLA-B-258ENST00000640615 240 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 PPARG-207ENST00000397015 1722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 XIST-211ENST00000635841 1734 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 SIRT5-201ENST00000359782 3797 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 KIAA1217-208ENST00000396446 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 DNAH11-202ENST00000409508 14167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 NUCB2-201ENST00000323688 1905 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 PCDH15-233ENST00000621708 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 ZNF185-212ENST00000539731 4334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
ZBED2Q9BTP6 AC025031.5-201ENST00000623851 2523 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.6 ms