Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUBP2Q9Y5Y2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms