Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms