Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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