Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms