Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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