Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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