Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-DMAP28067 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DMAP28067 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms