Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.418e-10■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.36e-10■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.076e-10■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 16e-10■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.996e-10■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.956e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 SRSF11-204ENST00000395136 1408 ntTSL 1 (best)20.37■□□□□ 0.856e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 THRA-205ENST00000577288 581 ntTSL 419.79■□□□□ 0.766e-10■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 THRA-210ENST00000585047 574 ntTSL 418.81■□□□□ 0.66e-10■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 THRA-208ENST00000578218 907 ntTSL 418.59■□□□□ 0.576e-10■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.546e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.412e-10■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.46e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.366e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.346e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.322e-10■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.296e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.282e-10■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.26e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 CSNK1D-215ENST00000580784 1081 ntTSL 1 (best)16.02■□□□□ 0.166e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 SLC25A16-205ENST00000493963 1121 ntTSL 1 (best)15.92■□□□□ 0.143e-9■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.146e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 YJEFN3-202ENST00000458210 2785 ntTSL 215.5■□□□□ 0.072e-10■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.066e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 LMBR1L-205ENST00000547670 1866 ntTSL 1 (best)15.37■□□□□ 0.056e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.036e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.027e-12■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 LMBR1L-202ENST00000417750 2334 ntTSL 215□□□□□ -0.016e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.036e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.096e-10■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.156e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 UBE2Q2-203ENST00000561723 575 ntTSL 414.05□□□□□ -0.166e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.186e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 C20orf194-202ENST00000619760 2151 ntTSL 213.88□□□□□ -0.192e-9■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 LMBR1L-210ENST00000549296 560 ntTSL 513.72□□□□□ -0.216e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 CSNK1D-217ENST00000581241 6094 ntTSL 213.56□□□□□ -0.246e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 IRAK4-209ENST00000550386 1751 ntTSL 213.3□□□□□ -0.286e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.297e-12■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 LMBR1L-203ENST00000457164 1081 ntTSL 213.16□□□□□ -0.36e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 LMBR1L-214ENST00000550137 529 ntTSL 413.16□□□□□ -0.36e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 LMBR1L-206ENST00000547675 581 ntTSL 513.16□□□□□ -0.36e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.36e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 CSNK1D-201ENST00000269361 1088 ntTSL 513.12□□□□□ -0.316e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 ITGA7-204ENST00000553276 972 ntTSL 512.9□□□□□ -0.346e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.386e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 LMBR1L-216ENST00000550867 2800 ntTSL 1 (best)12.54□□□□□ -0.46e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 LMBR1L-225ENST00000552153 549 ntTSL 412.35□□□□□ -0.436e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.456e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 CSNK1D-222ENST00000584377 2891 ntTSL 212.16□□□□□ -0.466e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.496e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 ITGA7-212ENST00000555687 573 ntTSL 511.97□□□□□ -0.496e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.56e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC11.82□□□□□ -0.526e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 IRAK4-213ENST00000552309 1000 ntTSL 511.71□□□□□ -0.536e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 CSNK1D-220ENST00000581737 631 ntTSL 211.69□□□□□ -0.546e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 IRAK4-206ENST00000547521 1757 ntTSL 211.44□□□□□ -0.586e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.646e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 ITGA7-213ENST00000555728 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.696e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 CSNK1D-208ENST00000578501 1124 ntTSL 210.49□□□□□ -0.736e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 AKAP9-216ENST00000619023 6006 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.733e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 ITGA7-203ENST00000452168 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.736e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 ITGA7-215ENST00000556273 558 ntTSL 410.4□□□□□ -0.746e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 LMBR1L-230ENST00000553204 582 ntTSL 310.39□□□□□ -0.756e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 CSNK1D-224ENST00000584672 401 ntTSL 310.21□□□□□ -0.776e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 ITGA7-206ENST00000553804 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.856e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 CCDC18-AS1-204ENST00000415150 448 ntTSL 39.58□□□□□ -0.886e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 SEPT8-211ENST00000453480 773 ntTSL 59.49□□□□□ -0.896e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 ITGA7-210ENST00000554543 707 ntTSL 39.48□□□□□ -0.896e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 CSNK1D-206ENST00000577578 928 ntTSL 29.42□□□□□ -0.96e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 AKAP9-214ENST00000493453 6020 ntTSL 28.58□□□□□ -1.043e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 SLC25A16-207ENST00000609923 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.043e-9■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 CCDC18-AS1-206ENST00000424517 270 ntTSL 58.5□□□□□ -1.056e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 CCDC18-AS1-222ENST00000457025 413 ntTSL 58.5□□□□□ -1.056e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 CCDC18-AS1-207ENST00000427669 383 ntTSL 38.5□□□□□ -1.056e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 GAPVD1-219ENST00000495955 5309 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.126e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 SLC25A16-201ENST00000265870 2295 ntTSL 28.06□□□□□ -1.126e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 LMBR1L-219ENST00000551169 771 ntTSL 58.06□□□□□ -1.126e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 CATSPER3-201ENST00000282611 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.146e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 SEPT8-202ENST00000371478 737 ntTSL 37.95□□□□□ -1.146e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 ZNF337-203ENST00000481610 572 ntTSL 37.88□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 LMBR1L-213ENST00000549730 585 ntTSL 57.69□□□□□ -1.186e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.26e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.219e-10■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 IRAK4-201ENST00000431837 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.216e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 IRAK4-214ENST00000613694 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.226e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 GAPVD1-204ENST00000394083 4747 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.236e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 MYO9A-211ENST00000564931 564 ntTSL 47.34□□□□□ -1.236e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 LMBR1L-212ENST00000549587 545 ntTSL 27.3□□□□□ -1.246e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 CCDC18-AS1-202ENST00000413606 770 ntTSL 37.29□□□□□ -1.246e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 LMBR1L-223ENST00000551854 535 ntTSL 47.21□□□□□ -1.266e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 ITGA7-218ENST00000557257 576 ntTSL 47.07□□□□□ -1.286e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.296e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 LMBR1L-222ENST00000551782 567 ntTSL 46.74□□□□□ -1.336e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 MACF1-226ENST00000497964 4160 ntTSL 26.65□□□□□ -1.346e-15■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.356e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 IRAK4-210ENST00000550615 1348 ntTSL 1 (best)6.57□□□□□ -1.366e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 SLC25A16-203ENST00000474927 311 ntTSL 56.49□□□□□ -1.376e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.386e-8■■■■■ 32.4
PTBP1P26599 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.391e-6■■■■■ 32.4
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 245.2 ms