RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585047.5

THRA-210, Transcript of thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

TSL 4

Gene THRA, Length 574 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRA-210ENST00000585047 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.05■■■■■ 7.36
THRA-210ENST00000585047 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.44■■■■■ 6.31
THRA-210ENST00000585047 ABCC9O60706 1549 aa53.74■■■■■ 6.19
THRA-210ENST00000585047 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.48■■■■■ 5.83
THRA-210ENST00000585047 NACADO15069 1562 aa51.32■■■■■ 5.81
THRA-210ENST00000585047 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.17■■■■■ 5.78
THRA-210ENST00000585047 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.87■■■■■ 5.73
THRA-210ENST00000585047 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.78■■■■■ 5.72
THRA-210ENST00000585047 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.49■■■■■ 5.67
THRA-210ENST00000585047 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.25■■■■■ 5.64
THRA-210ENST00000585047 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.15■■■■■ 5.62
THRA-210ENST00000585047 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.96■■■■■ 5.59
THRA-210ENST00000585047 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.77■■■■■ 5.56
THRA-210ENST00000585047 SCRIBQ14160 1630 aa49.66■■■■■ 5.54
THRA-210ENST00000585047 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.39■■■■■ 5.5
THRA-210ENST00000585047 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.68■■■■■ 5.38
THRA-210ENST00000585047 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.58■■■■■ 5.37
THRA-210ENST00000585047 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.35■■■■■ 5.33
THRA-210ENST00000585047 SMARCA4P51532 1647 aa47.46■■■■■ 5.19
THRA-210ENST00000585047 NCAPD3P42695 1498 aa47.38■■■■■ 5.17
THRA-210ENST00000585047 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.33■■■■■ 5.17
THRA-210ENST00000585047 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.33■■■■■ 5.17
THRA-210ENST00000585047 SMARCA2P51531 1590 aa47.24■■■■■ 5.15
THRA-210ENST00000585047 HMGXB3Q12766 1538 aa47.1■■■■■ 5.13
THRA-210ENST00000585047 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.05■■■■■ 5.12
THRA-210ENST00000585047 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.02■■■■■ 5.12
THRA-210ENST00000585047 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.91■■■■■ 5.1
THRA-210ENST00000585047 WIZO95785 1651 aa46.49■■■■■ 5.03
THRA-210ENST00000585047 NESP48681 1621 aa46.39■■■■■ 5.02
THRA-210ENST00000585047 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.36■■■■■ 5.01
THRA-210ENST00000585047 ERCC6Q03468 1493 aa46.35■■■■■ 5.01
THRA-210ENST00000585047 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.18■■■■■ 4.98
THRA-210ENST00000585047 CUX2O14529 1486 aa46.03■■■■■ 4.96
THRA-210ENST00000585047 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.99■■■■■ 4.95
THRA-210ENST00000585047 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.97■■■■■ 4.95
THRA-210ENST00000585047 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.89■■■■■ 4.94
THRA-210ENST00000585047 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.78■■■■■ 4.92
THRA-210ENST00000585047 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.77■■■■■ 4.92
THRA-210ENST00000585047 CFTRP13569 1480 aa45.61■■■■■ 4.89
THRA-210ENST00000585047 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.46■■■■■ 4.87
THRA-210ENST00000585047 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.46■■■■■ 4.87
THRA-210ENST00000585047 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.44■■■■■ 4.87
THRA-210ENST00000585047 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.42■■■■■ 4.86
THRA-210ENST00000585047 WDR62O43379 1518 aa45.32■■■■■ 4.85
THRA-210ENST00000585047 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.17■■■■■ 4.82
THRA-210ENST00000585047 PRDM2Q13029 1718 aa45.14■■■■■ 4.82
THRA-210ENST00000585047 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.03■■■■■ 4.8
THRA-210ENST00000585047 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.77
THRA-210ENST00000585047 TOPBP1Q92547 1522 aa44.66■■■■■ 4.74
THRA-210ENST00000585047 ABCC8Q09428 1581 aa44.6■■■■■ 4.73
THRA-210ENST00000585047 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.56■■■■■ 4.72
THRA-210ENST00000585047 IFT140Q96RY7 1462 aa44.49■■■■■ 4.71
THRA-210ENST00000585047 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
THRA-210ENST00000585047 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.27■■■■■ 4.68
THRA-210ENST00000585047 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.21■■■■■ 4.67
THRA-210ENST00000585047 CUX1P39880 1505 aa44.16■■■■■ 4.66
THRA-210ENST00000585047 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.65
THRA-210ENST00000585047 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.08■■■■■ 4.65
THRA-210ENST00000585047 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.08■■■■■ 4.65
THRA-210ENST00000585047 SOGA1O94964 1423 aa44.06■■■■■ 4.64
THRA-210ENST00000585047 OSCARQ8IYS5 282 aa44.04■■■■■ 4.64
THRA-210ENST00000585047 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.03■■■■■ 4.642e-6■■■■□ 25.7
THRA-210ENST00000585047 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
THRA-210ENST00000585047 WDR97A6NE52 1622 aa43.81■■■■■ 4.6
THRA-210ENST00000585047 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.72■■■■■ 4.59
THRA-210ENST00000585047 TOP2BQ02880 1626 aa43.65■■■■■ 4.58
THRA-210ENST00000585047 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.63■■■■■ 4.58
THRA-210ENST00000585047 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.63■■■■■ 4.58
THRA-210ENST00000585047 SYNJ1O43426 1573 aa43.63■■■■■ 4.57
THRA-210ENST00000585047 CHD1O14646 1710 aa43.62■■■■■ 4.57
THRA-210ENST00000585047 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.61■■■■■ 4.57
THRA-210ENST00000585047 GRIN2BQ13224 1484 aa43.6■■■■■ 4.57
THRA-210ENST00000585047 FBLN2P98095 1184 aa43.57■■■■■ 4.57
THRA-210ENST00000585047 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.55■■■■■ 4.56
THRA-210ENST00000585047 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
THRA-210ENST00000585047 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.49■■■■■ 4.55
THRA-210ENST00000585047 TRIM41Q8WV44 630 aa43.47■■■■■ 4.55
THRA-210ENST00000585047 PBRM1Q86U86 1689 aa43.44■■■■■ 4.54
THRA-210ENST00000585047 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.39■■■■■ 4.54
THRA-210ENST00000585047 SYNJ2O15056 1496 aa43.38■■■■■ 4.54
THRA-210ENST00000585047 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.37■■■■■ 4.53
THRA-210ENST00000585047 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.37■■■■■ 4.53
THRA-210ENST00000585047 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.37■■■■■ 4.53
THRA-210ENST00000585047 ARHGEF11O15085 1522 aa43.34■■■■■ 4.53
THRA-210ENST00000585047 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.2■■■■■ 4.51
THRA-210ENST00000585047 ADAMTS12P58397 1594 aa43.12■■■■■ 4.49
THRA-210ENST00000585047 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.1■■■■■ 4.49
THRA-210ENST00000585047 GRIN2AQ12879 1464 aa43.05■■■■■ 4.48
THRA-210ENST00000585047 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.03■■■■■ 4.48
THRA-210ENST00000585047 ARAP1Q96P48 1450 aa42.97■■■■■ 4.47
THRA-210ENST00000585047 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.95■■■■■ 4.47
THRA-210ENST00000585047 NUP160Q12769 1436 aa42.88■■■■■ 4.46
THRA-210ENST00000585047 CEP170Q5SW79 1584 aa42.85■■■■■ 4.45
THRA-210ENST00000585047 KIF27Q86VH2 1401 aa42.82■■■■■ 4.45
THRA-210ENST00000585047 IGF1RP08069 1367 aa42.73■■■■■ 4.43
THRA-210ENST00000585047 SHROOM2Q13796 1616 aa42.59■■■■■ 4.41
THRA-210ENST00000585047 CUL7Q14999 1698 aa42.59■■■■■ 4.41
THRA-210ENST00000585047 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.57■■■■■ 4.41
THRA-210ENST00000585047 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.49■■■■■ 4.39
THRA-210ENST00000585047 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.45■■■■■ 4.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms