Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI4P10075 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI4P10075 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI4P10075 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI4P10075 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI4P10075 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI4P10075 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI4P10075 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI4P10075 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI4P10075 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI4P10075 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GLI4P10075 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
GLI4P10075 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI4P10075 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI4P10075 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GLI4P10075 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GLI4P10075 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GLI4P10075 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GLI4P10075 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GLI4P10075 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GLI4P10075 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GLI4P10075 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GLI4P10075 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GLI4P10075 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GLI4P10075 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GLI4P10075 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GLI4P10075 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GLI4P10075 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GLI4P10075 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms