Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIPT2A6NK58 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms