Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms