Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC23IPQ9Y6Y8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC23IPQ9Y6Y8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC23IPQ9Y6Y8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC23IPQ9Y6Y8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC23IPQ9Y6Y8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC23IPQ9Y6Y8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC23IPQ9Y6Y8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC23IPQ9Y6Y8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC23IPQ9Y6Y8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC23IPQ9Y6Y8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC23IPQ9Y6Y8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC23IPQ9Y6Y8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC23IPQ9Y6Y8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC23IPQ9Y6Y8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC23IPQ9Y6Y8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC23IPQ9Y6Y8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC23IPQ9Y6Y8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC23IPQ9Y6Y8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC23IPQ9Y6Y8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEC23IPQ9Y6Y8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC23IPQ9Y6Y8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC23IPQ9Y6Y8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC23IPQ9Y6Y8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC23IPQ9Y6Y8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC23IPQ9Y6Y8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC23IPQ9Y6Y8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC23IPQ9Y6Y8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC23IPQ9Y6Y8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC23IPQ9Y6Y8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC23IPQ9Y6Y8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC23IPQ9Y6Y8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC23IPQ9Y6Y8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC23IPQ9Y6Y8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC23IPQ9Y6Y8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC23IPQ9Y6Y8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC23IPQ9Y6Y8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEC23IPQ9Y6Y8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEC23IPQ9Y6Y8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC23IPQ9Y6Y8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC23IPQ9Y6Y8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC23IPQ9Y6Y8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC23IPQ9Y6Y8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC23IPQ9Y6Y8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC23IPQ9Y6Y8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC23IPQ9Y6Y8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC23IPQ9Y6Y8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC23IPQ9Y6Y8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC23IPQ9Y6Y8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC23IPQ9Y6Y8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC23IPQ9Y6Y8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC23IPQ9Y6Y8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC23IPQ9Y6Y8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC23IPQ9Y6Y8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC23IPQ9Y6Y8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC23IPQ9Y6Y8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC23IPQ9Y6Y8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC23IPQ9Y6Y8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC23IPQ9Y6Y8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC23IPQ9Y6Y8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC23IPQ9Y6Y8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC23IPQ9Y6Y8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC23IPQ9Y6Y8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC23IPQ9Y6Y8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC23IPQ9Y6Y8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC23IPQ9Y6Y8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC23IPQ9Y6Y8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC23IPQ9Y6Y8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms