Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USH1CQ9Y6N9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USH1CQ9Y6N9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USH1CQ9Y6N9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USH1CQ9Y6N9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USH1CQ9Y6N9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USH1CQ9Y6N9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USH1CQ9Y6N9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USH1CQ9Y6N9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USH1CQ9Y6N9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USH1CQ9Y6N9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USH1CQ9Y6N9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USH1CQ9Y6N9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USH1CQ9Y6N9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USH1CQ9Y6N9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USH1CQ9Y6N9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USH1CQ9Y6N9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USH1CQ9Y6N9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USH1CQ9Y6N9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USH1CQ9Y6N9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
USH1CQ9Y6N9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USH1CQ9Y6N9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USH1CQ9Y6N9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USH1CQ9Y6N9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USH1CQ9Y6N9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USH1CQ9Y6N9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USH1CQ9Y6N9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USH1CQ9Y6N9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USH1CQ9Y6N9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USH1CQ9Y6N9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USH1CQ9Y6N9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USH1CQ9Y6N9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USH1CQ9Y6N9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms