Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L6

FRMD4B, FERM domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4BQ9Y2L6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FRMD4BQ9Y2L6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FRMD4BQ9Y2L6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRMD4BQ9Y2L6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMD4BQ9Y2L6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMD4BQ9Y2L6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMD4BQ9Y2L6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMD4BQ9Y2L6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRMD4BQ9Y2L6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FRMD4BQ9Y2L6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRMD4BQ9Y2L6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRMD4BQ9Y2L6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRMD4BQ9Y2L6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMD4BQ9Y2L6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMD4BQ9Y2L6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMD4BQ9Y2L6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMD4BQ9Y2L6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMD4BQ9Y2L6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMD4BQ9Y2L6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMD4BQ9Y2L6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMD4BQ9Y2L6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMD4BQ9Y2L6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMD4BQ9Y2L6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMD4BQ9Y2L6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMD4BQ9Y2L6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMD4BQ9Y2L6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMD4BQ9Y2L6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMD4BQ9Y2L6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMD4BQ9Y2L6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMD4BQ9Y2L6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMD4BQ9Y2L6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMD4BQ9Y2L6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FRMD4BQ9Y2L6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMD4BQ9Y2L6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMD4BQ9Y2L6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRMD4BQ9Y2L6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRMD4BQ9Y2L6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMD4BQ9Y2L6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMD4BQ9Y2L6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMD4BQ9Y2L6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMD4BQ9Y2L6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMD4BQ9Y2L6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMD4BQ9Y2L6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMD4BQ9Y2L6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMD4BQ9Y2L6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMD4BQ9Y2L6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMD4BQ9Y2L6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMD4BQ9Y2L6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMD4BQ9Y2L6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMD4BQ9Y2L6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMD4BQ9Y2L6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRMD4BQ9Y2L6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMD4BQ9Y2L6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMD4BQ9Y2L6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMD4BQ9Y2L6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMD4BQ9Y2L6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMD4BQ9Y2L6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMD4BQ9Y2L6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMD4BQ9Y2L6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMD4BQ9Y2L6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMD4BQ9Y2L6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMD4BQ9Y2L6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMD4BQ9Y2L6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMD4BQ9Y2L6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMD4BQ9Y2L6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMD4BQ9Y2L6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMD4BQ9Y2L6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMD4BQ9Y2L6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMD4BQ9Y2L6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMD4BQ9Y2L6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMD4BQ9Y2L6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMD4BQ9Y2L6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMD4BQ9Y2L6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMD4BQ9Y2L6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMD4BQ9Y2L6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMD4BQ9Y2L6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMD4BQ9Y2L6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMD4BQ9Y2L6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMD4BQ9Y2L6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMD4BQ9Y2L6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMD4BQ9Y2L6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMD4BQ9Y2L6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMD4BQ9Y2L6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMD4BQ9Y2L6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMD4BQ9Y2L6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMD4BQ9Y2L6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMD4BQ9Y2L6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMD4BQ9Y2L6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMD4BQ9Y2L6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMD4BQ9Y2L6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMD4BQ9Y2L6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMD4BQ9Y2L6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMD4BQ9Y2L6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms