Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y289

SLC5A6, Sodium-dependent multivitamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A6Q9Y289 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC5A6Q9Y289 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC5A6Q9Y289 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC5A6Q9Y289 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC5A6Q9Y289 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A6Q9Y289 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A6Q9Y289 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A6Q9Y289 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A6Q9Y289 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A6Q9Y289 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A6Q9Y289 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC5A6Q9Y289 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A6Q9Y289 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A6Q9Y289 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A6Q9Y289 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A6Q9Y289 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A6Q9Y289 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A6Q9Y289 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A6Q9Y289 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A6Q9Y289 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A6Q9Y289 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A6Q9Y289 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A6Q9Y289 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A6Q9Y289 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A6Q9Y289 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A6Q9Y289 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A6Q9Y289 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A6Q9Y289 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC5A6Q9Y289 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A6Q9Y289 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC5A6Q9Y289 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC5A6Q9Y289 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC5A6Q9Y289 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A6Q9Y289 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A6Q9Y289 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A6Q9Y289 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms