Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRTO4Q9UKD2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRTO4Q9UKD2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRTO4Q9UKD2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRTO4Q9UKD2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRTO4Q9UKD2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRTO4Q9UKD2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRTO4Q9UKD2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRTO4Q9UKD2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRTO4Q9UKD2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRTO4Q9UKD2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MRTO4Q9UKD2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRTO4Q9UKD2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRTO4Q9UKD2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MRTO4Q9UKD2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRTO4Q9UKD2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRTO4Q9UKD2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRTO4Q9UKD2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRTO4Q9UKD2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRTO4Q9UKD2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRTO4Q9UKD2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRTO4Q9UKD2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRTO4Q9UKD2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRTO4Q9UKD2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRTO4Q9UKD2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MRTO4Q9UKD2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRTO4Q9UKD2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRTO4Q9UKD2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRTO4Q9UKD2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRTO4Q9UKD2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRTO4Q9UKD2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRTO4Q9UKD2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRTO4Q9UKD2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRTO4Q9UKD2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRTO4Q9UKD2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRTO4Q9UKD2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MRTO4Q9UKD2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRTO4Q9UKD2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms