Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEFF2Q9UIK5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEFF2Q9UIK5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEFF2Q9UIK5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEFF2Q9UIK5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEFF2Q9UIK5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEFF2Q9UIK5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEFF2Q9UIK5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEFF2Q9UIK5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEFF2Q9UIK5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEFF2Q9UIK5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEFF2Q9UIK5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEFF2Q9UIK5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEFF2Q9UIK5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEFF2Q9UIK5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEFF2Q9UIK5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEFF2Q9UIK5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEFF2Q9UIK5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEFF2Q9UIK5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEFF2Q9UIK5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 908.1 ms