Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPZ2Q9P299 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPZ2Q9P299 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPZ2Q9P299 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPZ2Q9P299 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPZ2Q9P299 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPZ2Q9P299 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPZ2Q9P299 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPZ2Q9P299 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPZ2Q9P299 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPZ2Q9P299 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPZ2Q9P299 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPZ2Q9P299 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPZ2Q9P299 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPZ2Q9P299 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPZ2Q9P299 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPZ2Q9P299 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPZ2Q9P299 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COPZ2Q9P299 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPZ2Q9P299 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPZ2Q9P299 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPZ2Q9P299 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPZ2Q9P299 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPZ2Q9P299 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPZ2Q9P299 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPZ2Q9P299 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPZ2Q9P299 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COPZ2Q9P299 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COPZ2Q9P299 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPZ2Q9P299 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPZ2Q9P299 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPZ2Q9P299 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPZ2Q9P299 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPZ2Q9P299 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPZ2Q9P299 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPZ2Q9P299 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPZ2Q9P299 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPZ2Q9P299 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPZ2Q9P299 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPZ2Q9P299 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPZ2Q9P299 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPZ2Q9P299 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPZ2Q9P299 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPZ2Q9P299 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms