Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM53CQ9NYF3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
FAM53CQ9NYF3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM53CQ9NYF3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM53CQ9NYF3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM53CQ9NYF3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM53CQ9NYF3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM53CQ9NYF3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM53CQ9NYF3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM53CQ9NYF3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM53CQ9NYF3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM53CQ9NYF3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM53CQ9NYF3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FAM53CQ9NYF3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM53CQ9NYF3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM53CQ9NYF3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM53CQ9NYF3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM53CQ9NYF3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM53CQ9NYF3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM53CQ9NYF3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM53CQ9NYF3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM53CQ9NYF3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM53CQ9NYF3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM53CQ9NYF3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM53CQ9NYF3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM53CQ9NYF3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM53CQ9NYF3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM53CQ9NYF3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM53CQ9NYF3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM53CQ9NYF3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM53CQ9NYF3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM53CQ9NYF3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM53CQ9NYF3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM53CQ9NYF3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM53CQ9NYF3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM53CQ9NYF3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM53CQ9NYF3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM53CQ9NYF3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM53CQ9NYF3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM53CQ9NYF3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM53CQ9NYF3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM53CQ9NYF3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms