Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO1C1Q9NYB5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO1C1Q9NYB5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO1C1Q9NYB5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO1C1Q9NYB5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO1C1Q9NYB5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO1C1Q9NYB5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO1C1Q9NYB5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO1C1Q9NYB5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO1C1Q9NYB5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO1C1Q9NYB5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLCO1C1Q9NYB5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLCO1C1Q9NYB5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO1C1Q9NYB5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms