Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX58

LYAR, Cell growth-regulating nucleolar protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYARQ9NX58 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LYARQ9NX58 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYARQ9NX58 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LYARQ9NX58 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LYARQ9NX58 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LYARQ9NX58 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LYARQ9NX58 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LYARQ9NX58 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LYARQ9NX58 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LYARQ9NX58 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LYARQ9NX58 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LYARQ9NX58 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LYARQ9NX58 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LYARQ9NX58 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LYARQ9NX58 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LYARQ9NX58 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LYARQ9NX58 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LYARQ9NX58 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LYARQ9NX58 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYARQ9NX58 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYARQ9NX58 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYARQ9NX58 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYARQ9NX58 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYARQ9NX58 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LYARQ9NX58 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LYARQ9NX58 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LYARQ9NX58 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LYARQ9NX58 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LYARQ9NX58 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LYARQ9NX58 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LYARQ9NX58 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LYARQ9NX58 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LYARQ9NX58 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LYARQ9NX58 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LYARQ9NX58 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LYARQ9NX58 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LYARQ9NX58 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LYARQ9NX58 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LYARQ9NX58 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LYARQ9NX58 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LYARQ9NX58 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LYARQ9NX58 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LYARQ9NX58 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LYARQ9NX58 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LYARQ9NX58 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LYARQ9NX58 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LYARQ9NX58 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms