Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIC8BQ9NVN3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIC8BQ9NVN3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIC8BQ9NVN3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIC8BQ9NVN3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIC8BQ9NVN3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RIC8BQ9NVN3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIC8BQ9NVN3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIC8BQ9NVN3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIC8BQ9NVN3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIC8BQ9NVN3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIC8BQ9NVN3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIC8BQ9NVN3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIC8BQ9NVN3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIC8BQ9NVN3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIC8BQ9NVN3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIC8BQ9NVN3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIC8BQ9NVN3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIC8BQ9NVN3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIC8BQ9NVN3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIC8BQ9NVN3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIC8BQ9NVN3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIC8BQ9NVN3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIC8BQ9NVN3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RIC8BQ9NVN3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIC8BQ9NVN3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIC8BQ9NVN3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIC8BQ9NVN3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIC8BQ9NVN3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIC8BQ9NVN3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIC8BQ9NVN3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIC8BQ9NVN3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIC8BQ9NVN3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIC8BQ9NVN3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIC8BQ9NVN3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIC8BQ9NVN3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIC8BQ9NVN3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIC8BQ9NVN3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIC8BQ9NVN3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RIC8BQ9NVN3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIC8BQ9NVN3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIC8BQ9NVN3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIC8BQ9NVN3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RIC8BQ9NVN3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIC8BQ9NVN3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIC8BQ9NVN3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIC8BQ9NVN3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIC8BQ9NVN3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIC8BQ9NVN3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIC8BQ9NVN3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIC8BQ9NVN3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIC8BQ9NVN3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIC8BQ9NVN3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIC8BQ9NVN3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIC8BQ9NVN3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIC8BQ9NVN3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIC8BQ9NVN3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIC8BQ9NVN3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIC8BQ9NVN3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIC8BQ9NVN3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIC8BQ9NVN3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIC8BQ9NVN3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIC8BQ9NVN3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIC8BQ9NVN3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIC8BQ9NVN3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIC8BQ9NVN3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIC8BQ9NVN3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIC8BQ9NVN3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIC8BQ9NVN3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIC8BQ9NVN3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIC8BQ9NVN3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIC8BQ9NVN3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIC8BQ9NVN3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIC8BQ9NVN3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIC8BQ9NVN3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIC8BQ9NVN3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIC8BQ9NVN3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIC8BQ9NVN3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIC8BQ9NVN3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIC8BQ9NVN3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIC8BQ9NVN3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIC8BQ9NVN3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIC8BQ9NVN3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIC8BQ9NVN3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms