Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FANCIQ9NVI1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
FANCIQ9NVI1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FANCIQ9NVI1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
FANCIQ9NVI1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
FANCIQ9NVI1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
FANCIQ9NVI1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FANCIQ9NVI1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
FANCIQ9NVI1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
FANCIQ9NVI1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
FANCIQ9NVI1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FANCIQ9NVI1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FANCIQ9NVI1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FANCIQ9NVI1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FANCIQ9NVI1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FANCIQ9NVI1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FANCIQ9NVI1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FANCIQ9NVI1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FANCIQ9NVI1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FANCIQ9NVI1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCIQ9NVI1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCIQ9NVI1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FANCIQ9NVI1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FANCIQ9NVI1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FANCIQ9NVI1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FANCIQ9NVI1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FANCIQ9NVI1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FANCIQ9NVI1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FANCIQ9NVI1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
FANCIQ9NVI1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
FANCIQ9NVI1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCIQ9NVI1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FANCIQ9NVI1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FANCIQ9NVI1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCIQ9NVI1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCIQ9NVI1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FANCIQ9NVI1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FANCIQ9NVI1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FANCIQ9NVI1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
FANCIQ9NVI1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FANCIQ9NVI1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FANCIQ9NVI1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
FANCIQ9NVI1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
FANCIQ9NVI1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FANCIQ9NVI1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FANCIQ9NVI1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FANCIQ9NVI1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
FANCIQ9NVI1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
FANCIQ9NVI1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
FANCIQ9NVI1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
FANCIQ9NVI1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
FANCIQ9NVI1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FANCIQ9NVI1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
FANCIQ9NVI1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FANCIQ9NVI1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FANCIQ9NVI1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FANCIQ9NVI1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FANCIQ9NVI1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FANCIQ9NVI1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FANCIQ9NVI1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FANCIQ9NVI1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FANCIQ9NVI1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
FANCIQ9NVI1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
FANCIQ9NVI1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
FANCIQ9NVI1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FANCIQ9NVI1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
FANCIQ9NVI1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
FANCIQ9NVI1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
FANCIQ9NVI1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
FANCIQ9NVI1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
FANCIQ9NVI1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
FANCIQ9NVI1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
FANCIQ9NVI1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
FANCIQ9NVI1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
FANCIQ9NVI1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
FANCIQ9NVI1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FANCIQ9NVI1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
FANCIQ9NVI1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FANCIQ9NVI1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms