Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE7

PANK4, Pantothenate kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK4Q9NVE7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PANK4Q9NVE7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PANK4Q9NVE7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PANK4Q9NVE7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PANK4Q9NVE7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PANK4Q9NVE7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PANK4Q9NVE7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PANK4Q9NVE7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PANK4Q9NVE7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PANK4Q9NVE7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PANK4Q9NVE7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PANK4Q9NVE7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PANK4Q9NVE7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PANK4Q9NVE7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PANK4Q9NVE7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PANK4Q9NVE7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PANK4Q9NVE7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PANK4Q9NVE7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PANK4Q9NVE7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PANK4Q9NVE7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PANK4Q9NVE7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PANK4Q9NVE7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PANK4Q9NVE7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PANK4Q9NVE7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PANK4Q9NVE7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PANK4Q9NVE7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PANK4Q9NVE7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PANK4Q9NVE7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PANK4Q9NVE7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PANK4Q9NVE7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PANK4Q9NVE7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PANK4Q9NVE7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PANK4Q9NVE7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PANK4Q9NVE7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PANK4Q9NVE7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PANK4Q9NVE7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PANK4Q9NVE7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PANK4Q9NVE7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PANK4Q9NVE7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PANK4Q9NVE7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PANK4Q9NVE7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PANK4Q9NVE7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PANK4Q9NVE7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PANK4Q9NVE7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PANK4Q9NVE7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PANK4Q9NVE7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PANK4Q9NVE7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PANK4Q9NVE7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PANK4Q9NVE7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PANK4Q9NVE7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PANK4Q9NVE7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PANK4Q9NVE7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PANK4Q9NVE7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PANK4Q9NVE7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PANK4Q9NVE7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PANK4Q9NVE7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PANK4Q9NVE7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PANK4Q9NVE7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PANK4Q9NVE7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PANK4Q9NVE7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PANK4Q9NVE7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PANK4Q9NVE7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PANK4Q9NVE7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PANK4Q9NVE7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PANK4Q9NVE7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PANK4Q9NVE7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PANK4Q9NVE7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PANK4Q9NVE7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PANK4Q9NVE7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PANK4Q9NVE7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PANK4Q9NVE7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PANK4Q9NVE7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PANK4Q9NVE7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PANK4Q9NVE7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PANK4Q9NVE7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PANK4Q9NVE7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PANK4Q9NVE7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PANK4Q9NVE7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PANK4Q9NVE7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PANK4Q9NVE7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PANK4Q9NVE7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PANK4Q9NVE7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PANK4Q9NVE7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PANK4Q9NVE7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PANK4Q9NVE7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PANK4Q9NVE7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PANK4Q9NVE7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PANK4Q9NVE7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PANK4Q9NVE7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PANK4Q9NVE7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PANK4Q9NVE7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PANK4Q9NVE7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PANK4Q9NVE7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PANK4Q9NVE7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PANK4Q9NVE7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PANK4Q9NVE7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PANK4Q9NVE7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PANK4Q9NVE7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PANK4Q9NVE7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PANK4Q9NVE7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms