Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DUOX1Q9NRD9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DUOX1Q9NRD9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DUOX1Q9NRD9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DUOX1Q9NRD9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DUOX1Q9NRD9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DUOX1Q9NRD9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DUOX1Q9NRD9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DUOX1Q9NRD9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DUOX1Q9NRD9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DUOX1Q9NRD9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DUOX1Q9NRD9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
DUOX1Q9NRD9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
DUOX1Q9NRD9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DUOX1Q9NRD9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DUOX1Q9NRD9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
DUOX1Q9NRD9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DUOX1Q9NRD9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
DUOX1Q9NRD9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
DUOX1Q9NRD9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DUOX1Q9NRD9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
DUOX1Q9NRD9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DUOX1Q9NRD9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
DUOX1Q9NRD9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DUOX1Q9NRD9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DUOX1Q9NRD9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DUOX1Q9NRD9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
DUOX1Q9NRD9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DUOX1Q9NRD9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
DUOX1Q9NRD9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
DUOX1Q9NRD9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
DUOX1Q9NRD9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
DUOX1Q9NRD9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DUOX1Q9NRD9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
DUOX1Q9NRD9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
DUOX1Q9NRD9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DUOX1Q9NRD9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
DUOX1Q9NRD9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
DUOX1Q9NRD9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
DUOX1Q9NRD9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
DUOX1Q9NRD9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
DUOX1Q9NRD9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
DUOX1Q9NRD9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
DUOX1Q9NRD9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
DUOX1Q9NRD9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
DUOX1Q9NRD9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DUOX1Q9NRD9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DUOX1Q9NRD9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DUOX1Q9NRD9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DUOX1Q9NRD9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DUOX1Q9NRD9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DUOX1Q9NRD9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DUOX1Q9NRD9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DUOX1Q9NRD9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DUOX1Q9NRD9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
DUOX1Q9NRD9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
DUOX1Q9NRD9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DUOX1Q9NRD9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DUOX1Q9NRD9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DUOX1Q9NRD9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DUOX1Q9NRD9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
DUOX1Q9NRD9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DUOX1Q9NRD9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DUOX1Q9NRD9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
DUOX1Q9NRD9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DUOX1Q9NRD9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DUOX1Q9NRD9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DUOX1Q9NRD9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DUOX1Q9NRD9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DUOX1Q9NRD9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
DUOX1Q9NRD9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DUOX1Q9NRD9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DUOX1Q9NRD9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DUOX1Q9NRD9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DUOX1Q9NRD9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
DUOX1Q9NRD9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
DUOX1Q9NRD9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
DUOX1Q9NRD9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
DUOX1Q9NRD9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
DUOX1Q9NRD9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
DUOX1Q9NRD9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.89■■■□□ 2.69
DUOX1Q9NRD9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
DUOX1Q9NRD9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
DUOX1Q9NRD9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
DUOX1Q9NRD9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
DUOX1Q9NRD9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
DUOX1Q9NRD9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
DUOX1Q9NRD9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
DUOX1Q9NRD9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
DUOX1Q9NRD9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
DUOX1Q9NRD9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
DUOX1Q9NRD9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
DUOX1Q9NRD9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
DUOX1Q9NRD9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
DUOX1Q9NRD9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
DUOX1Q9NRD9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
DUOX1Q9NRD9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
DUOX1Q9NRD9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
DUOX1Q9NRD9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
DUOX1Q9NRD9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms