Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POLE4Q9NR33 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLE4Q9NR33 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLE4Q9NR33 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLE4Q9NR33 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLE4Q9NR33 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLE4Q9NR33 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLE4Q9NR33 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLE4Q9NR33 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLE4Q9NR33 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLE4Q9NR33 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLE4Q9NR33 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLE4Q9NR33 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms