Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAH1

ZNF556, Zinc finger protein 556, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF556Q9HAH1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF556Q9HAH1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF556Q9HAH1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF556Q9HAH1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF556Q9HAH1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF556Q9HAH1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF556Q9HAH1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF556Q9HAH1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF556Q9HAH1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF556Q9HAH1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF556Q9HAH1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF556Q9HAH1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF556Q9HAH1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF556Q9HAH1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF556Q9HAH1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF556Q9HAH1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF556Q9HAH1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF556Q9HAH1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF556Q9HAH1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF556Q9HAH1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF556Q9HAH1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF556Q9HAH1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF556Q9HAH1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms