Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 MFSD10-208ENST00000509676 1178 ntTSL 514.25□□□□□ -0.135e-9■■■■■ 35.5
CSTF2TQ9H0L4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.255e-7■■■■■ 35.5
CSTF2TQ9H0L4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 35.5
CSTF2TQ9H0L4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 35.5
CSTF2TQ9H0L4 WARS-202ENST00000355338 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 35.5
CSTF2TQ9H0L4 WARS-201ENST00000344102 2690 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 35.5
CSTF2TQ9H0L4 WARS-220ENST00000554950 1376 ntTSL 28.95□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 35.5
CSTF2TQ9H0L4 WARS-238ENST00000557135 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -12e-7■■■■■ 35.5
CSTF2TQ9H0L4 WARS-204ENST00000392882 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 35.5
CSTF2TQ9H0L4 WARS-242ENST00000557614 499 ntTSL 27.79□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 35.5
CSTF2TQ9H0L4 PQLC1-212ENST00000590895 865 ntTSL 315.96■□□□□ 0.157e-8■■■■■ 35.5
CSTF2TQ9H0L4 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.254e-11■■■■■ 35.4
CSTF2TQ9H0L4 SREBF1-216ENST00000490796 698 ntTSL 218.73■□□□□ 0.593e-9■■■■■ 35.2
CSTF2TQ9H0L4 SREBF1-204ENST00000395756 3026 ntTSL 215.92■□□□□ 0.143e-9■■■■■ 35.2
CSTF2TQ9H0L4 SREBF1-207ENST00000447641 644 ntTSL 313.06□□□□□ -0.323e-9■■■■■ 35.2
CSTF2TQ9H0L4 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.323e-9■■■■■ 35.2
CSTF2TQ9H0L4 SREBF1-223ENST00000584760 564 ntTSL 212.43□□□□□ -0.423e-9■■■■■ 35.2
CSTF2TQ9H0L4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.955e-7■■■■■ 35.2
CSTF2TQ9H0L4 PHF23-208ENST00000574236 583 ntTSL 321.85■■□□□ 1.095e-11■■■■■ 35.1
CSTF2TQ9H0L4 PHF23-211ENST00000574899 370 ntTSL 321.85■■□□□ 1.095e-11■■■■■ 35.1
CSTF2TQ9H0L4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.718e-9■■■■■ 35.1
CSTF2TQ9H0L4 CALM1-207ENST00000553964 2670 ntTSL 1 (best)18.25■□□□□ 0.518e-9■■■■■ 35.1
CSTF2TQ9H0L4 CALM1-215ENST00000557123 569 ntTSL 316.46■□□□□ 0.238e-9■■■■■ 35.1
CSTF2TQ9H0L4 CALM1-208ENST00000553995 583 ntTSL 216.46■□□□□ 0.238e-9■■■■■ 35.1
CSTF2TQ9H0L4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.238e-9■■■■■ 35.1
CSTF2TQ9H0L4 CALM1-210ENST00000555132 554 ntTSL 416.46■□□□□ 0.238e-9■■■■■ 35.1
CSTF2TQ9H0L4 CALM1-213ENST00000556757 588 ntTSL 216.46■□□□□ 0.238e-9■■■■■ 35.1
CSTF2TQ9H0L4 CALM1-206ENST00000553630 1420 ntTSL 516.34■□□□□ 0.218e-9■■■■■ 35.1
CSTF2TQ9H0L4 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.218e-9■■■■■ 35.1
CSTF2TQ9H0L4 CALM1-214ENST00000557020 557 ntTSL 411.85□□□□□ -0.518e-9■■■■■ 35.1
CSTF2TQ9H0L4 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.568e-9■■■■■ 35.1
CSTF2TQ9H0L4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.693e-7■■■■■ 35
CSTF2TQ9H0L4 ZNF148-204ENST00000471196 566 ntTSL 418.23■□□□□ 0.513e-7■■■■■ 35
CSTF2TQ9H0L4 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 35
CSTF2TQ9H0L4 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.433e-7■■■■■ 35
CSTF2TQ9H0L4 ZNF148-207ENST00000492394 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.813e-7■■■■■ 35
CSTF2TQ9H0L4 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.33e-7■■■■■ 35
CSTF2TQ9H0L4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 35
CSTF2TQ9H0L4 NUMBL-204ENST00000595741 559 ntTSL 416.04■□□□□ 0.163e-7■■■■■ 35
CSTF2TQ9H0L4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.161e-9■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.921e-9■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.821e-9■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.241e-9■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 YIF1B-208ENST00000587361 579 ntTSL 321.6■■□□□ 1.057e-7■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.837e-7■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.647e-7■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 YIF1B-212ENST00000589644 1917 ntTSL 217.02■□□□□ 0.317e-7■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 YIF1B-205ENST00000585563 1118 ntTSL 316.68■□□□□ 0.267e-7■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.147e-7■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.057e-7■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 YIF1B-207ENST00000587039 466 ntTSL 514.94□□□□□ -0.027e-7■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.087e-7■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.157e-7■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 YIF1B-211ENST00000589247 734 ntTSL 213.71□□□□□ -0.217e-7■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 FAM169A-204ENST00000510609 5908 ntTSL 1 (best)12.53□□□□□ -0.41e-10■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.862e-7■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)20.45■□□□□ 0.862e-7■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)20.45■□□□□ 0.862e-7■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)19.49■□□□□ 0.712e-7■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 34.9
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0355-206ENST00000589583 582 ntTSL 314.22□□□□□ -0.131e-10■■■■■ 34.8
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0355-204ENST00000588470 632 ntTSL 514.2□□□□□ -0.141e-10■■■■■ 34.8
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0355-201ENST00000299505 6717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.751e-10■■■■■ 34.8
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0355-203ENST00000588338 561 ntTSL 58.72□□□□□ -1.011e-10■■■■■ 34.8
CSTF2TQ9H0L4 PICALM-215ENST00000531558 565 ntTSL 524.03■■□□□ 1.448e-8■■■■■ 34.8
CSTF2TQ9H0L4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.128e-8■■■■■ 34.8
CSTF2TQ9H0L4 PICALM-218ENST00000532041 699 ntTSL 321.86■■□□□ 1.098e-8■■■■■ 34.8
CSTF2TQ9H0L4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.078e-8■■■■■ 34.8
CSTF2TQ9H0L4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.028e-8■■■■■ 34.8
CSTF2TQ9H0L4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -08e-8■■■■■ 34.8
CSTF2TQ9H0L4 PICALM-210ENST00000528411 586 ntTSL 514.06□□□□□ -0.168e-8■■■■■ 34.8
CSTF2TQ9H0L4 PICALM-217ENST00000531930 703 ntTSL 58.89□□□□□ -0.998e-8■■■■■ 34.8
CSTF2TQ9H0L4 PICALM-208ENST00000528256 563 ntTSL 48.26□□□□□ -1.098e-8■■■■■ 34.8
CSTF2TQ9H0L4 PICALM-203ENST00000525162 548 ntTSL 47.68□□□□□ -1.188e-8■■■■■ 34.8
CSTF2TQ9H0L4 PICALM-223ENST00000534412 811 ntTSL 57.67□□□□□ -1.188e-8■■■■■ 34.8
CSTF2TQ9H0L4 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.238e-8■■■■■ 34.8
CSTF2TQ9H0L4 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.588e-8■■■■■ 34.8
CSTF2TQ9H0L4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.116e-7■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 BAGE2-201ENST00000470054 1891 ntTSL 1 (best)13.59□□□□□ -0.236e-7■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 SPATS2-212ENST00000549298 643 ntTSL 322.38■■□□□ 1.178e-9■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 SPATS2-218ENST00000551540 720 ntTSL 521.45■■□□□ 1.028e-9■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 SPATS2-211ENST00000549179 570 ntTSL 421.45■■□□□ 1.028e-9■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 SPATS2-209ENST00000548777 505 ntTSL 320.66■□□□□ 0.98e-9■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 SPATS2-214ENST00000549412 2781 ntTSL 218.95■□□□□ 0.628e-9■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 NUP54-205ENST00000507257 1938 ntTSL 516.9■□□□□ 0.37e-10■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 PSMD12-207ENST00000584008 1752 ntTSL 1 (best)16.6■□□□□ 0.257e-10■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 SPATS2-219ENST00000552171 465 ntTSL 516.43■□□□□ 0.228e-9■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 SPATS2-205ENST00000548388 564 ntTSL 216.43■□□□□ 0.228e-9■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.077e-10■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 NUP54-214ENST00000514307 566 ntTSL 414.45□□□□□ -0.17e-10■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 SPATS2-217ENST00000550997 675 ntTSL 514.06□□□□□ -0.168e-9■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 SPATS2-216ENST00000550643 527 ntTSL 413.92□□□□□ -0.188e-9■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 NUP54-213ENST00000513352 579 ntTSL 413.83□□□□□ -0.27e-10■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.237e-10■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.268e-9■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 NUP54-216ENST00000514901 500 ntTSL 313.25□□□□□ -0.297e-10■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.38e-9■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.338e-9■■■■■ 34.7
Retrieved 100 of 19,151 protein–RNA pairs in 371.4 ms