Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSP1Q9GZU7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSP1Q9GZU7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSP1Q9GZU7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSP1Q9GZU7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSP1Q9GZU7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSP1Q9GZU7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSP1Q9GZU7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSP1Q9GZU7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTDSP1Q9GZU7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTDSP1Q9GZU7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSP1Q9GZU7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSP1Q9GZU7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CTDSP1Q9GZU7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms