Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NMES1Q9C002 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NMES1Q9C002 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NMES1Q9C002 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NMES1Q9C002 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NMES1Q9C002 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NMES1Q9C002 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NMES1Q9C002 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NMES1Q9C002 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NMES1Q9C002 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NMES1Q9C002 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NMES1Q9C002 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NMES1Q9C002 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NMES1Q9C002 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NMES1Q9C002 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NMES1Q9C002 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NMES1Q9C002 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NMES1Q9C002 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NMES1Q9C002 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NMES1Q9C002 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NMES1Q9C002 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMES1Q9C002 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMES1Q9C002 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NMES1Q9C002 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NMES1Q9C002 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NMES1Q9C002 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NMES1Q9C002 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NMES1Q9C002 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NMES1Q9C002 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NMES1Q9C002 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NMES1Q9C002 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NMES1Q9C002 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NMES1Q9C002 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NMES1Q9C002 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NMES1Q9C002 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NMES1Q9C002 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NMES1Q9C002 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NMES1Q9C002 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NMES1Q9C002 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NMES1Q9C002 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMES1Q9C002 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMES1Q9C002 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMES1Q9C002 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMES1Q9C002 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMES1Q9C002 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMES1Q9C002 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMES1Q9C002 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms