Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHCBP1LQ9BZQ2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHCBP1LQ9BZQ2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHCBP1LQ9BZQ2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SHCBP1LQ9BZQ2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHCBP1LQ9BZQ2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHCBP1LQ9BZQ2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHCBP1LQ9BZQ2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHCBP1LQ9BZQ2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHCBP1LQ9BZQ2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHCBP1LQ9BZQ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHCBP1LQ9BZQ2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SHCBP1LQ9BZQ2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHCBP1LQ9BZQ2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHCBP1LQ9BZQ2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHCBP1LQ9BZQ2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHCBP1LQ9BZQ2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHCBP1LQ9BZQ2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHCBP1LQ9BZQ2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHCBP1LQ9BZQ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SHCBP1LQ9BZQ2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHCBP1LQ9BZQ2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHCBP1LQ9BZQ2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHCBP1LQ9BZQ2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHCBP1LQ9BZQ2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHCBP1LQ9BZQ2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHCBP1LQ9BZQ2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHCBP1LQ9BZQ2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHCBP1LQ9BZQ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHCBP1LQ9BZQ2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHCBP1LQ9BZQ2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHCBP1LQ9BZQ2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHCBP1LQ9BZQ2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms