Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM109Q9BVC6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM109Q9BVC6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM109Q9BVC6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM109Q9BVC6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM109Q9BVC6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM109Q9BVC6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM109Q9BVC6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM109Q9BVC6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM109Q9BVC6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM109Q9BVC6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM109Q9BVC6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM109Q9BVC6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM109Q9BVC6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM109Q9BVC6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM109Q9BVC6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM109Q9BVC6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM109Q9BVC6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM109Q9BVC6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM109Q9BVC6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM109Q9BVC6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM109Q9BVC6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM109Q9BVC6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM109Q9BVC6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM109Q9BVC6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM109Q9BVC6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM109Q9BVC6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM109Q9BVC6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM109Q9BVC6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM109Q9BVC6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM109Q9BVC6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM109Q9BVC6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM109Q9BVC6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM109Q9BVC6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM109Q9BVC6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM109Q9BVC6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM109Q9BVC6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM109Q9BVC6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM109Q9BVC6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM109Q9BVC6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM109Q9BVC6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM109Q9BVC6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM109Q9BVC6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM109Q9BVC6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM109Q9BVC6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM109Q9BVC6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM109Q9BVC6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM109Q9BVC6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM109Q9BVC6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM109Q9BVC6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM109Q9BVC6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM109Q9BVC6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM109Q9BVC6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM109Q9BVC6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM109Q9BVC6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM109Q9BVC6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM109Q9BVC6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms