Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBB2BQ9BVA1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBB2BQ9BVA1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBB2BQ9BVA1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBB2BQ9BVA1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBB2BQ9BVA1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBB2BQ9BVA1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBB2BQ9BVA1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TUBB2BQ9BVA1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBB2BQ9BVA1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TUBB2BQ9BVA1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TUBB2BQ9BVA1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TUBB2BQ9BVA1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBB2BQ9BVA1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TUBB2BQ9BVA1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBB2BQ9BVA1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBB2BQ9BVA1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TUBB2BQ9BVA1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TUBB2BQ9BVA1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBB2BQ9BVA1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TUBB2BQ9BVA1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TUBB2BQ9BVA1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TUBB2BQ9BVA1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TUBB2BQ9BVA1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TUBB2BQ9BVA1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TUBB2BQ9BVA1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TUBB2BQ9BVA1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBB2BQ9BVA1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBB2BQ9BVA1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBB2BQ9BVA1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBB2BQ9BVA1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBB2BQ9BVA1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBB2BQ9BVA1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBB2BQ9BVA1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBB2BQ9BVA1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUBB2BQ9BVA1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUBB2BQ9BVA1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBB2BQ9BVA1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBB2BQ9BVA1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBB2BQ9BVA1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBB2BQ9BVA1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBB2BQ9BVA1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBB2BQ9BVA1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBB2BQ9BVA1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBB2BQ9BVA1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TUBB2BQ9BVA1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TUBB2BQ9BVA1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBB2BQ9BVA1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBB2BQ9BVA1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBB2BQ9BVA1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBB2BQ9BVA1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBB2BQ9BVA1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBB2BQ9BVA1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBB2BQ9BVA1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBB2BQ9BVA1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBB2BQ9BVA1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBB2BQ9BVA1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBB2BQ9BVA1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBB2BQ9BVA1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB2BQ9BVA1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB2BQ9BVA1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB2BQ9BVA1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBB2BQ9BVA1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBB2BQ9BVA1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBB2BQ9BVA1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBB2BQ9BVA1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB2BQ9BVA1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB2BQ9BVA1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB2BQ9BVA1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB2BQ9BVA1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB2BQ9BVA1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB2BQ9BVA1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBB2BQ9BVA1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBB2BQ9BVA1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms