Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RETNLBQ9BQ08 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RETNLBQ9BQ08 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RETNLBQ9BQ08 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms