Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX18Q96RF0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX18Q96RF0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX18Q96RF0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX18Q96RF0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX18Q96RF0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX18Q96RF0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX18Q96RF0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX18Q96RF0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX18Q96RF0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX18Q96RF0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX18Q96RF0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX18Q96RF0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX18Q96RF0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX18Q96RF0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX18Q96RF0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX18Q96RF0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX18Q96RF0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX18Q96RF0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX18Q96RF0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX18Q96RF0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX18Q96RF0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX18Q96RF0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX18Q96RF0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX18Q96RF0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX18Q96RF0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX18Q96RF0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX18Q96RF0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX18Q96RF0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX18Q96RF0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX18Q96RF0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX18Q96RF0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX18Q96RF0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX18Q96RF0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX18Q96RF0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX18Q96RF0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX18Q96RF0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX18Q96RF0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX18Q96RF0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX18Q96RF0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms