Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
OPALINQ96PE5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OPALINQ96PE5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPALINQ96PE5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPALINQ96PE5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPALINQ96PE5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPALINQ96PE5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OPALINQ96PE5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23■■□□□ 1.27
OPALINQ96PE5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPALINQ96PE5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPALINQ96PE5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPALINQ96PE5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPALINQ96PE5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPALINQ96PE5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPALINQ96PE5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPALINQ96PE5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
OPALINQ96PE5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPALINQ96PE5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPALINQ96PE5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPALINQ96PE5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPALINQ96PE5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPALINQ96PE5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms